Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms