Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chrac1Q9JKP8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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