Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms