Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp29Q9ES63 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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