Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Stx12Q9ER00 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Stx12Q9ER00 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms