Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnft1Q9DCN7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnft1Q9DCN7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms