Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt112Q9DCG9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms