Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Olfr631-201ENSMUST00000106863 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms