Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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