Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Smg9Q9DB90 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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