Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms