Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lin37Q9D8N6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms