Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tnfrsf13cQ9D8D0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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