Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slx4ipQ9D7Y9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slx4ipQ9D7Y9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slx4ipQ9D7Y9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slx4ipQ9D7Y9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Slx4ipQ9D7Y9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slx4ipQ9D7Y9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slx4ipQ9D7Y9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms