Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms