Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms