Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc83Q9D4V3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms