Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syce1Q9D495 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms