Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms