Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx20Q9D2Y5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Snx20Q9D2Y5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Snx20Q9D2Y5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Snx20Q9D2Y5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx20Q9D2Y5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms