Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Trappc6bQ9D289 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Trappc6bQ9D289 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc6bQ9D289 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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