Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syf2Q9D198 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms