Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc47Q9D024 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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