Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Snf8Q9CZ28 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Snf8Q9CZ28 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Snf8Q9CZ28 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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