Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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