Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms