Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2fQ9CY34 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms