Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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