Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atg12Q9CQY1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg12Q9CQY1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms