Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdm1Q9CQK3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms