Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf2Q9CQJ4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf2Q9CQJ4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf2Q9CQJ4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf2Q9CQJ4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf2Q9CQJ4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf2Q9CQJ4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf2Q9CQJ4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf2Q9CQJ4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf2Q9CQJ4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf2Q9CQJ4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf2Q9CQJ4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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