Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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