Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms