Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ergic3Q9CQE7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ergic3Q9CQE7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ergic3Q9CQE7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ergic3Q9CQE7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ergic3Q9CQE7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms