Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5aQ9CQD1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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