Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl1Q99N96 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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