Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SrrtQ99MR6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms