Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms