Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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