Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b3Q921M3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b3Q921M3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms