Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms