Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atl3Q91YH5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms