Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usb1Q91W78 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usb1Q91W78 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usb1Q91W78 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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