Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms