Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc115Q8VE99 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms