Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc39cQ8VE09 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms