Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms