Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Uhrf1Q8VDF2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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