Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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