Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx2ipQ8VC66 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx2ipQ8VC66 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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